Záštitu nad Nocou kostolov 2012 prevzal
Mons. Róbert Bezák, trnavský arcibiskup
Mons. Ján Babjak SJ, prešovský arcibiskup a metropolita
Juraj Kohút, kazateľ Cirkvi bratskej v Trnave
Tibor Mikuš, predseda Trnavského samosprávneho kraja
Daniel Hevier, spisovateľ
Ladislav Elek, komárňanský dekan
Patrik Bacigál, smolenický dekan
Samuel Ondrušek, Cirkev adventistov siedmeho dňa
László Parák, šaliansky dekan